財政部臺北國稅局表示，教育、文化、公益、慈善機關或團體（下稱機關團體）各項收支均應取具合法憑證及有完備會計紀錄，倘機關團體短漏報收入情節非屬輕微者，屬會計紀錄不完備，其結餘款應課徵所得稅。

該局說明，依教育文化公益慈善機關或團體免納所得稅適用標準（下稱免稅適用標準）第2條第1項第9款規定，機關團體財務收支應給與、取得及保存合法之憑證，有完備之會計紀錄，並經主管稽徵機關查核屬實。又依財政部83年6月1日台財稅第831595361號函規定，機關團體年度結算申報短漏報收入不超過新臺幣（下同）10萬元或短漏報收入占核定全年收入之比例不超過10%，且非以詐術或其他不正當方法逃漏稅捐者，得視為短漏報情節輕微，符合前開免稅適用標準帳證完備之規定。因此，機關團體短漏報收入超過10萬元且占核定全年收入之比例超過10%者，即不符合帳證完備之要件，應依法課徵所得稅。

該局舉例說明，甲基金會112年度所得稅結算申報，列報銷售貨物或勞務以外之收入150萬元，與創設目的有關之支出130萬元，惟經查核發現甲基金會短漏報捐贈收入40萬元，已超過10萬元，且短漏報收入40萬元占核定全年收入190萬元之比例21.05%，亦超過10%，因不符合上述短漏報情節輕微之情形，致與免稅適用標準第2條第1項第9款規定未合，遂就當年度全部餘絀數60萬元（收入190萬元-支出130萬元），依適用稅率20%補徵所得稅12萬元，並依所得稅法第110條規定處罰。

該局呼籲，機關團體取得各項收入，應詳實登載會計紀錄，以免因短漏報收入致不符合帳證完備規定而遭補稅處罰。

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