秘書室掌理文書、事務、出納、檔案等事宜。分設四股，其職掌如下：
| 股別 | 業務職掌 |
|---|---|
| 文書股 | (一) 公文書之總收文及分文。 (二) 郵件處理、登錄、交換及統計。 (三) 文稿之收派繕、校對、用印、發文、付郵及移送歸檔。 (四) 印信典守。 (五) 各單位公文收發作業之聯繫及督促。 (六) 密件分文、檢舉人資料彌封及密件資料管制。 |
| 事務股 | (一) 土地及建築物之產權登記、維修及管理。 (二) 財產之接管、維護、報廢及變賣。 (三) 辦公廳舍、首長宿舍之修繕維護。 (四) 各種辦公用品、器材之購置、核發及保管。 (五) 司機、技工、工友之僱免及管理。 (六) 車輛之調派、管理及汰購。 (七) 油料、水電、電話及辦公環境衛生之管理。 (八) 各項事務費用之支付、報銷。 (九) 各會議場所之管理。 (十) 防護團之組訓事宜。 (十一) 辦理各項採購作業。 (十二) 辦公環境之維護。 |
| 出納股 | (一) 薪資及各項補助費發放。 (二) 法院扣款。 (三) 擔保品之收受、保管及退還。 (四) 各項專戶之收支及記帳。 (五) 所得稅扣繳及扣繳憑單申報。 (六) 完成付款憑單之送件、領回支票之轉發及檢舉獎金之核銷作業。 (七) 零用金核銷及保管。 |
| 檔案股 | (一) 歸檔文稿之點收、立案、編目、保管。 (二) 檔案清查、銷毀、移轉等作業。 (三) 檔案文稿之檢調及安全維護。 (四) 檔案管理工作計畫之擬定、督促及執行。 (五) 分局、稽徵所檔案管理作業規劃與督導。 (六) 檔案目錄彙送。 |