法務組掌理營業稅、營利事業所得稅、綜合所得稅、遺產及贈與稅、貨物稅、菸酒稅、證券交易稅、期貨交易稅、特種貨物及勞務稅行政救濟、違章處理及相關法律事務等事宜。分設六股，其職掌如下：
| 股別 | 業務職掌 |
|---|---|
| 行政救濟一股 | (一) 復查案件之處理。 (二) 訴願、行政訴訟案件之答辯、出庭及上訴等事項。 (三) 其他有關行政救濟案件案例之分析及研究改進事項。 (四) 行政救濟案件管制、催辦及績效統計事項。 (五) 辦理復查委員會之提會及決議事項相關事宜。 (六) 其他行政事項之處理。 |
| 行政救濟二股 | (一) 復查案件之處理。 (二) 訴願、行政訴訟案件之答辯、出庭及上訴等事項。 (三) 其他有關行政救濟案件案例之分析及研究改進事項。 (四) 行政救濟案件管制、催辦及績效統計事項。 (五) 其他行政事項之處理。 |
| 行政救濟三股 | (一) 復查案件之處理。 (二) 訴願、行政訴訟案件之答辯、出庭及上訴等事項。 (三) 其他有關行政救濟案件案例之分析及研究改進事項。 (四) 行政救濟案件管制、催辦及績效統計事項。 (五) 其他行政事項之處理。 |
| 行政救濟四股 | (一) 復查案件之處理。 (二) 訴願、行政訴訟案件之答辯、出庭及上訴等事項。 (三) 其他有關行政救濟案件案例之分析及研究改進事項。 (四) 行政救濟案件管制、催辦及績效統計事項。 (五) 對分局、稽徵所相關業務之督導、績效統計及其他有關事項之處理。 (六) 其他行政事項之處理。 |
| 違章股 | (一) 違章案件(含更正裁罰案件)之審理及裁罰。 (二) 辦理記帳士法第34條處罰案件之審理及處罰等事項。 (三) 辦理裁罰審議小組之提會及決議事項相關事宜。 (四) 違章案件管制、催辦及績效統計事項。 (五) 舉發獎金之分配及核發。 (六) 對分局、稽徵所相關業務之督導、績效統計及其他有關事項之處理。 (七) 公文收發、管制及催辦。 (八) 其他行政事項之處理。 |
| 法規股 | (一) 稅務法令之轉行。 (二) 稅務法令修正意見之彙報。 (三) 稅務法令之蒐集、整理及彙編。 (四) 稅務法令適用疑義之研議。 (五) 稅務法令適用疑義之審議。 (六) 刑事訴訟案件(不含虛設行號及虛設行號下游案件)之處理。 (七) 國家賠償案件之處理。 (八) 辦理記帳士法第34條處罰案件之行政救濟事項。 (九) 納保案件管制、催辦及績效統計事項。 (十) 其他行政事項之處理。 |